MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Xylella fastidiosa subsp. fastidiosa GB514 plasmid unnamed

Total Repeats: 531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017561	GT	3	6	11	16	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017561	CCA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017561	TGG	2	6	152	157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017561	ACG	2	6	255	260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017561	CGC	2	6	275	280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017561	GTT	2	6	302	307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017561	CCTGTT	2	12	338	349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017561	GCG	3	9	360	368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017561	GCT	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017561	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017561	TTC	2	6	420	425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017561	GTT	2	6	427	432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017561	CAG	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017561	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017561	GTT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017561	CTTTG	2	10	554	563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017561	TCT	2	6	592	597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017561	GGT	2	6	657	662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017561	CGT	2	6	663	668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017561	CCG	2	6	827	832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085389
21	NC_017561	CCA	2	6	902	907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085389
22	NC_017561	CGC	2	6	924	929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085389
23	NC_017561	GAC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
24	NC_017561	C	6	6	991	996	0 %	0 %	0 %	100 %	386085389
25	NC_017561	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085389
26	NC_017561	ACGA	2	8	1135	1142	50 %	0 %	25 %	25 %	386085389
27	NC_017561	TGCT	2	8	1209	1216	0 %	50 %	25 %	25 %	386085389
28	NC_017561	AGGGG	2	10	1245	1254	20 %	0 %	80 %	0 %	386085389
29	NC_017561	G	6	6	1251	1256	0 %	0 %	100 %	0 %	386085389
30	NC_017561	TGA	2	6	1391	1396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
31	NC_017561	CTT	2	6	1424	1429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085389
32	NC_017561	ATC	2	6	1534	1539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
33	NC_017561	CAT	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
34	NC_017561	CGT	2	6	1562	1567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
35	NC_017561	G	6	6	1571	1576	0 %	0 %	100 %	0 %	386085389
36	NC_017561	TCG	2	6	1627	1632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
37	NC_017561	CAG	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
38	NC_017561	TGT	2	6	1688	1693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085389
39	NC_017561	ATG	2	6	1723	1728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
40	NC_017561	TCA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
41	NC_017561	AGC	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
42	NC_017561	AAG	2	6	1824	1829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085389
43	NC_017561	CTG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
44	NC_017561	A	8	8	1836	1843	100 %	0 %	0 %	0 %	386085389
45	NC_017561	CGAA	2	8	1994	2001	50 %	0 %	25 %	25 %	386085389
46	NC_017561	GCT	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085389
47	NC_017561	ATG	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
48	NC_017561	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
49	NC_017561	CAG	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
50	NC_017561	CCT	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085389
51	NC_017561	ACC	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085389
52	NC_017561	GAA	2	6	2559	2564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085389
53	NC_017561	A	6	6	2566	2571	100 %	0 %	0 %	0 %	386085389
54	NC_017561	ATGG	2	8	2596	2603	25 %	25 %	50 %	0 %	386085389
55	NC_017561	ATC	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085389
56	NC_017561	GTA	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
57	NC_017561	CGC	2	6	2656	2661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085389
58	NC_017561	GCA	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085389
59	NC_017561	ATG	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085389
60	NC_017561	CAGG	2	8	2741	2748	25 %	0 %	50 %	25 %	386085389
61	NC_017561	CTT	2	6	2790	2795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085389
62	NC_017561	GCG	2	6	2834	2839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085389
63	NC_017561	T	6	6	2990	2995	0 %	100 %	0 %	0 %	386085390
64	NC_017561	T	6	6	3028	3033	0 %	100 %	0 %	0 %	386085390
65	NC_017561	GAA	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085390
66	NC_017561	AAC	2	6	3041	3046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085390
67	NC_017561	GTC	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085390
68	NC_017561	ATG	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085390
69	NC_017561	TGGA	2	8	3165	3172	25 %	25 %	50 %	0 %	386085390
70	NC_017561	TCA	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085390
71	NC_017561	A	7	7	3315	3321	100 %	0 %	0 %	0 %	386085390
72	NC_017561	ATCA	2	8	3404	3411	50 %	25 %	0 %	25 %	386085390
73	NC_017561	CGT	2	6	3425	3430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085390
74	NC_017561	GCC	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085390
75	NC_017561	A	6	6	3491	3496	100 %	0 %	0 %	0 %	386085390
76	NC_017561	TCA	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085390
77	NC_017561	GCAG	2	8	3668	3675	25 %	0 %	50 %	25 %	386085390
78	NC_017561	GCA	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085390
79	NC_017561	CTT	2	6	3746	3751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085390
80	NC_017561	GA	3	6	3793	3798	50 %	0 %	50 %	0 %	386085390
81	NC_017561	GCCTG	2	10	3857	3866	0 %	20 %	40 %	40 %	386085390
82	NC_017561	CAT	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085390
83	NC_017561	CAA	2	6	3986	3991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085390
84	NC_017561	TCACG	2	10	4013	4022	20 %	20 %	20 %	40 %	386085391
85	NC_017561	CCA	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085391
86	NC_017561	ACC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085391
87	NC_017561	GGGA	2	8	4068	4075	25 %	0 %	75 %	0 %	386085391
88	NC_017561	TTGA	2	8	4143	4150	25 %	50 %	25 %	0 %	386085391
89	NC_017561	ATG	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085391
90	NC_017561	CA	3	6	4354	4359	50 %	0 %	0 %	50 %	386085391
91	NC_017561	TCAA	2	8	4426	4433	50 %	25 %	0 %	25 %	386085391
92	NC_017561	GTT	2	6	4461	4466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085391
93	NC_017561	CGT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
94	NC_017561	GCT	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
95	NC_017561	GCC	2	6	4690	4695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085391
96	NC_017561	TGC	3	9	4717	4725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
97	NC_017561	GAA	2	6	4735	4740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085391
98	NC_017561	GTG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386085391
99	NC_017561	TGC	3	9	4858	4866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085391
100	NC_017561	GCA	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085391
101	NC_017561	GCA	2	6	4906	4911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085391
102	NC_017561	CTT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085391
103	NC_017561	TTC	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085391
104	NC_017561	CTT	3	9	4989	4997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085391
105	NC_017561	TCAA	2	8	5017	5024	50 %	25 %	0 %	25 %	386085391
106	NC_017561	ATT	2	6	5043	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386085391
107	NC_017561	GATG	2	8	5098	5105	25 %	25 %	50 %	0 %	386085391
108	NC_017561	CCA	2	6	5141	5146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085391
109	NC_017561	ACCAA	2	10	5167	5176	60 %	0 %	0 %	40 %	386085391
110	NC_017561	AATC	2	8	5282	5289	50 %	25 %	0 %	25 %	386085391
111	NC_017561	GC	3	6	5411	5416	0 %	0 %	50 %	50 %	386085392
112	NC_017561	GTTT	2	8	5451	5458	0 %	75 %	25 %	0 %	386085392
113	NC_017561	CAA	2	6	5483	5488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085392
114	NC_017561	GAA	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085392
115	NC_017561	GAA	2	6	5516	5521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085392
116	NC_017561	TCG	2	6	5571	5576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085392
117	NC_017561	GCG	2	6	5580	5585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085392
118	NC_017561	CAC	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085392
119	NC_017561	T	6	6	5641	5646	0 %	100 %	0 %	0 %	386085392
120	NC_017561	GCA	2	6	5658	5663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386085392
121	NC_017561	GTTT	2	8	5788	5795	0 %	75 %	25 %	0 %	386085392
122	NC_017561	TCT	2	6	5824	5829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085392
123	NC_017561	TGT	2	6	5848	5853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085392
124	NC_017561	CAA	2	6	5897	5902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386085392
125	NC_017561	GT	3	6	5970	5975	0 %	50 %	50 %	0 %	386085392
126	NC_017561	AGA	2	6	5987	5992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386085392
127	NC_017561	TTG	2	6	5994	5999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085392
128	NC_017561	T	6	6	6074	6079	0 %	100 %	0 %	0 %	386085392
129	NC_017561	TGC	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085393
130	NC_017561	TCA	2	6	6156	6161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085393
131	NC_017561	TTGAA	2	10	6170	6179	40 %	40 %	20 %	0 %	386085393
132	NC_017561	AGT	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085393
133	NC_017561	ATTGA	2	10	6412	6421	40 %	40 %	20 %	0 %	386085393
134	NC_017561	CCAA	2	8	6471	6478	50 %	0 %	0 %	50 %	386085393
135	NC_017561	TTG	2	6	6482	6487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085393
136	NC_017561	ACT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085393
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267	NC_017561	AGC	2	6	13770	13775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_017561	TGT	2	6	13780	13785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386085403
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270	NC_017561	AT	3	6	13861	13866	50 %	50 %	0 %	0 %	386085403
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272	NC_017561	TGA	2	6	13903	13908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085403
273	NC_017561	ATG	2	6	13911	13916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085403
274	NC_017561	GT	3	6	13917	13922	0 %	50 %	50 %	0 %	386085403
275	NC_017561	AAGC	2	8	13983	13990	50 %	0 %	25 %	25 %	386085403
276	NC_017561	ATG	2	6	13994	13999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085403
277	NC_017561	TTGCA	2	10	14078	14087	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
278	NC_017561	CGC	2	6	14135	14140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085404
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280	NC_017561	ATG	2	6	14229	14234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085404
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292	NC_017561	ATCC	2	8	14545	14552	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
293	NC_017561	GAA	2	6	14617	14622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_017561	CTA	2	6	14645	14650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_017561	GAAA	2	8	14651	14658	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
296	NC_017561	ATC	2	6	14715	14720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_017561	TCCT	2	8	14744	14751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
298	NC_017561	TCT	2	6	14754	14759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_017561	CCG	2	6	14818	14823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_017561	AAC	2	6	14830	14835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_017561	GGT	2	6	14849	14854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
302	NC_017561	CAG	2	6	14880	14885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_017561	AAT	2	6	14911	14916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_017561	AC	3	6	20266	20271	50 %	0 %	0 %	50 %	386085413
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399	NC_017561	TTCC	2	8	20383	20390	0 %	50 %	0 %	50 %	386085413
400	NC_017561	TCA	2	6	20395	20400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085413
401	NC_017561	TTTC	2	8	20424	20431	0 %	75 %	0 %	25 %	386085413
402	NC_017561	ATTT	2	8	20432	20439	25 %	75 %	0 %	0 %	386085413
403	NC_017561	TGT	2	6	20463	20468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
404	NC_017561	CATC	2	8	20535	20542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
405	NC_017561	TGA	2	6	20570	20575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
406	NC_017561	ACC	2	6	20594	20599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
407	NC_017561	GTGAA	2	10	20613	20622	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
408	NC_017561	TTA	2	6	20628	20633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_017561	T	7	7	20639	20645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_017561	ATT	2	6	20661	20666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_017561	TCA	2	6	20691	20696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_017561	CTTT	2	8	20728	20735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
413	NC_017561	T	6	6	20745	20750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_017561	CTT	3	9	20755	20763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
415	NC_017561	T	6	6	20762	20767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_017561	TCT	2	6	20799	20804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085414
417	NC_017561	T	6	6	20811	20816	0 %	100 %	0 %	0 %	386085414
418	NC_017561	TTC	2	6	20836	20841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085414
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422	NC_017561	CCT	2	6	20940	20945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386085414
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424	NC_017561	CT	3	6	20977	20982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
425	NC_017561	TGT	2	6	20987	20992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_017561	ATT	2	6	21029	21034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_017561	AGT	2	6	21062	21067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017561	TGA	2	6	21073	21078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
429	NC_017561	ATTTT	2	10	21086	21095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_017561	AATT	2	8	21117	21124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NC_017561	TGT	2	6	21134	21139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017561	T	6	6	21183	21188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_017561	T	6	6	21194	21199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_017561	AGT	2	6	21237	21242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_017561	TTG	2	6	21284	21289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_017561	ACC	2	6	21391	21396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386085415
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438	NC_017561	GA	3	6	21581	21586	50 %	0 %	50 %	0 %	386085415
439	NC_017561	TGA	2	6	21601	21606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386085415
440	NC_017561	TTC	2	6	21613	21618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386085415
441	NC_017561	TAC	2	6	21626	21631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085415
442	NC_017561	GCG	2	6	21783	21788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386085415
443	NC_017561	A	8	8	21808	21815	100 %	0 %	0 %	0 %	386085415
444	NC_017561	CGC	2	6	21827	21832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386085415
445	NC_017561	AAAT	2	8	21929	21936	75 %	25 %	0 %	0 %	386085415
446	NC_017561	TTA	2	6	21937	21942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017561	CAT	2	6	21949	21954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085416
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451	NC_017561	TAC	2	6	22267	22272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085417
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463	NC_017561	GCGTGT	2	12	22791	22802	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386085417
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473	NC_017561	GGA	2	6	23324	23329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_017561	CAT	2	6	23368	23373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085418
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497	NC_017561	AAAT	2	8	24551	24558	75 %	25 %	0 %	0 %	386085420
498	NC_017561	TCA	2	6	24585	24590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386085420
499	NC_017561	GT	4	8	24629	24636	0 %	50 %	50 %	0 %	386085420
500	NC_017561	GTC	2	6	24644	24649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386085420

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